詹姆斯·库克大学在学生教育质量方面被评为5星级学校(2006年最佳大学指南)，是一家在科学研究领域享有卓著声誉的大学，并且被瑞士科学技术研究中心“世界研究精英联盟”评为澳洲8所最佳大学之一。在澳洲教育、科学与技术部最近举办的一次调查中，在学生对课程的满意度方面，JCU被评为澳洲最好的3所大学之一。

澳大利亚政府认同詹姆斯·库克大学的研究能力，对学校某些领域的研究给予了高度的重视和极大的支持。詹姆斯·库克大学在很多领域的研究也获得了国际认可，特别是在海洋科学、生物多样性、热带生态和环境、全球变暖、旅游、热带医学和公共健康等方面。

关于热带地区的研究，詹姆斯·库克大学在国际上处于遥遥领先的地位。学校有着独特的地理位置，不仅潮湿的热带雨林，也有干旱的大草原，更有标志性的大堡礁，这一切为学生提供了世界上任何一个大学都无法比拟的生态环境，在学习和研究上有着极大的优势。学校利用这得天独厚的自然地理优势，建立了五个研究站和观测站，供师生和学者们对珊瑚礁、热带雨林、滨海湿地、林地草原和内陆干旱地区的生态环境进行研究和观测，努力为世界各地热带地区的人们创造一个更加美好的生活环境。